《南洋公学章程》由首任校长何嗣焜亲自制定并亲笔书写，全文约四、五千字，共分15章。对校长、教务长、中外教师、办事员等的职责做了明确的规定；对学生的礼节、教室、宿舍、餐厅等方面的管理，也做了具体的规范；奖励、惩罚分明。本章程是南洋公学的总章程，从中可以了解到当时公学的总面貌。它是交大“要求严”办学传统的源头；是交大建校办学最重要的凭证和纪念物；也是迄今所发现的中国高校最早的一份管理章程原件，对于研究中国近代高等教育思想和高等教育史有着极为重要的史料价值。
